Od 1. srpna 2009 je platná nová verze Pokynů pro české žadatele. Mezi důležitou změnu patří úprava výše způsobilých výdajů u upomínkových předmětů a také nemožnost pořízení osobního vozidla.
Nové Pokyn jsou zveřejněny na stránkách strukturalni-fondy.cz v sekci Dokumenty.