Podle § 58 odst. 1 zákona jsou od daně osvobozeny zdravotnické služby, kterými se rozumí služby zdravotní péče a služby související, které jsou poskytovány oprávněnými subjekty (státními i nestátními zdravotnickými zařízeními) pacientům a osobám, jímž je taková péče určena, bez ohledu na to, kdo je hradí (zdravotní pojišťovny, pacienti, jiné fyzické a právnické osoby).
Služby, které nesplňují výše uvedená kritéria určená § 58 zákona, od daně z přidané hodnoty osvobozeny nejsou. Jedná se například o následující činnosti: zpracování klinických studií, sterilizace nástrojů pro cizí subjekty, stravování (mimo stravování, které je uskutečňováno v rámci zdravotnických služeb), praní prádla pro jiné subjekty, nájem chladícího boxu na patologii, exkurze a stáže (pokud je zdravotnickým zařízením účtována úhrada), laboratorní vyšetření pro veterinární účely.